Determinación y evaluación de la microbiota intestinal común a la población colombiana
Fecha
2017
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Editor
Universidad EAFIT
Resumen
Descripción
La paradoja existente entre la altísima variación entre individuos en la composición microbiana del intestino humano y la homogeneidad en el potencial funcional de tal variedad de especies conduce a explorar la existencia de un núcleo microbiano común a un grupo de individuos -- Dicho concepto permitiría entender la fracción mínima de especies y/o funciones que tienen que estar presentes en la microbiota intestinal para que el hospedero funcione adecuadamente -- Con este trabajo se hace una exploración del núcleo microbiano a partir de datos de la caracterización de la microbiota intestinal de 441 colombianos -- Este análisis está basado en conceptos de la ecología tradicional, como lo son la composición, las relaciones filogenéticas y la membresía de las especies presentes en la comunidad -- En esta tesis se encuentra que en la cohorte muestreada no existen unidades taxonómicas operativas (OTUs) compartidas por el 100% de los individuos -- Sin embargo, se detectaron cuatro OTUs en el 99% (Escherichia coli, Faecalibacterium prausnitzii, Roseburia faecis y Blautia sp.) y 19 OTUs en el 95% de los individuos -- A partir de los datos de abundancia se encontró que las OTUs que más prevalecen en la microbiota intestinal de los colombianos son de taxa dominantes -- Respecto al potencial funcional hallado bajo distintos parámetros de prevalencia y abundancia, los análisis hechos exponen una serie de módulos metabólicos sobre-representados a medida que se consideran parámetros más estrictos -- En conclusión, a pesar de la alta riqueza de especies y la alta variabilidad entre individuos, el análisis de los diferentes núcleos de membresía, composición, filogenético y funcional indican que las 19 OTUs compartidas por el 95% de la cohorte de estudio, junto con sus funciones metabólicas, representarían el núcleo microbiano de la población colombiana
Palabras clave
Microbiota intestinal, Intestino humano, Composición microbiana, Núcleo microbiano, Unidad taxonómica, Microbiota humana, Microorganismos, Análisis filogenético, Identificación bacteriana, ARNr 16s