Análisis integrativo de la variación genómica y fenotípica en subpoblaciones de Allium fistulosum L. del banco de germoplasma colombiano

Rendón Vélez, Sofía

Publicación:
Análisis integrativo de la variación genómica y fenotípica en subpoblaciones de Allium fistulosum L. del banco de germoplasma colombiano

dc.contributor.advisor	Correa Álvarez, Javier
dc.contributor.advisor	Florián Cruz, Andrés Felipe
dc.contributor.author	Rendón Vélez, Sofía
dc.coverage.spatial	Medellín de: Lat: 06 15 00 N degrees minutes Lat: 6.2500 decimal degrees Long: 075 36 00 W degrees minutes Long: -75.6000 decimal degrees
dc.creator.email	srendonv3@eafit.edu.co
dc.date.accessioned	2026-07-31T20:41:19Z
dc.date.available	2026-07-31T20:41:19Z
dc.date.issued	2026-05-04
dc.description	La caracterización de la variación intra-poblacional en cultivos clonales representa un reto analítico debido a la superposición entre señal genética, variación fenotípica y procesos evolutivos continuos. En este estudio se evaluó la estructura genética y su relación con la variación morfoagronómica entre dos subgrupos (V1 y V2) de Allium fistulosum pertenecientes al grupo P2 del banco de germoplasma colombiano. Se integraron datos fenotípicos y genómicos mediante un enfoque exploratorio basado en análisis multivariados y estimación de diferenciación alélica a partir de 104,251 SNPs obtenidos por ddRAD-seq. La diferenciación genética se cuantificó mediante ΔAF y su significancia se evaluó mediante un procedimiento de permutación que permitió construir una distribución nula empírica bajo la hipótesis de ausencia de diferenciación entre subgrupos. A nivel fenotípico, se observaron diferencias significativas en rasgos asociados al crecimiento y biomasa, aunque los análisis multivariados evidenciaron un amplio solapamiento entre V1 y V2, indicando una estructura continua. En contraste, el PCA genómico mostró una separación más consistente entre subgrupos, aunque distribuida en múltiples componentes de baja varianza explicada. El análisis de ΔAF evidenció una baja diferenciación genómica global, con predominio de valores inferiores a 0.30, junto con la presencia de un subconjunto de SNPs con valores elevados en distintas regiones del genoma. La integración genotipo–fenotipo mostró asociaciones de magnitud baja a moderada, sin evidencia de relaciones directas. En conjunto, los resultados describen patrones de diferenciación parcial, pero no permiten establecer conclusiones definitivas, resaltando la necesidad de análisis adicionales para interpretar la base biológica subyacente.
dc.description.degreelevel	Trabajo	spa
dc.description.degreename	Biólogo(a)	spa
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.identifier.instname	instname:Universidad EAFIT
dc.identifier.reponame	reponame:Repositorio Institucional Universidad EAFIT
dc.identifier.repourl	repourl:https://repository.eafit.edu.co
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/10784/38260
dc.language.iso	spa
dc.publisher	Universidad EAFIT	spa
dc.publisher.department	Área Sistemas Naturales y Sostenibilidad	spa
dc.publisher.faculty	Escuela de Ciencias Aplicadas e Ingeniería	spa
dc.publisher.place	Medellín
dc.publisher.program	Biología	spa
dc.rights	Todos los derechos reservados	spa
dc.rights.accessrights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coar	http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.local	Acceso abierto
dc.subject	Cebolla de rama
dc.subject	RAD-seq
dc.subject	Diferenciación genética
dc.subject	Frecuencia alélica
dc.subject	Variación fenotípica
dc.subject	Mejoramiento vegetal
dc.subject	Marcadores genéticos
dc.subject.lemb	BIOLOGÍA - INVESTIGACIONES
dc.subject.lemb	MEJORAMIENTO DE LAS ESPECIES
dc.subject.lemb	MEJORAMIENTO SELECTIVO DE LAS PLANTAS
dc.subject.lemb	VARIACIÓN (BIOLOGÍA)
dc.title	Análisis integrativo de la variación genómica y fenotípica en subpoblaciones de Allium fistulosum L. del banco de germoplasma colombiano
dc.type	info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.coar	http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.coarversion	http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
dc.type.local	Trabajo de grado	spa
dc.type.redcol	http://purl.org/redcol/resource_type/TP
dc.type.spa	Artículo
dc.type.version	info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dspace.entity.type	Publication