Evaluación de marcadores moleculares de cloroplasto y nucleares, para su uso en identificación molecular de germoplasmas de orquídeas

Resumen

Orchids are the most diverse and evolved group of flowering plants in the world; presenting specificity for pollination, water intake and associations with specific fungi to satisfy their nutritional needs. They are plants of great importance for the ecosystems they inhabit, since they contribute directly to its water regulation. In addition, they provide shelter and food for various organisms such as insects, birds, and mammals. Likewise, orchids are commercially important as ornamental and medicinal plants, as cut flower for export and for the extraction of essences such as vanilla. That is why when propagating and distributing them it is necessary to have them fully identified in order to adequately preserve the characteristics of the germplasms. Since it has been shown that the phenotypic characteristics are insufficient for the identification of these plants, this study was developed in order to evaluate the use of chloroplast molecular markers (MAT-K, YCF-1 and TRNL-TRNF) and nuclear (ITS) for the identification of different genera of orchids, in the seedling stage. In this research, PCR protocols were standardized for the molecular markers presented, in order to develop replicable techniques for the molecular identification of orchids. Identification at the genera level of the analyzed germplasms was carried out using the molecular marker TRNL-TRNF. In this way, scientific and technological knowledge is generated that helps the sustainable and responsible use of orchids at the national level.

Descripción

Las orquídeas son el grupo de plantas con flores más diverso y evolucionado del mundo; presentando especificidad para la polinización, toma de agua y asociaciones con hongos específicos para satisfacer sus necesidades nutricionales. Son plantas de gran importancia para los ecosistemas que habitan, ya que contribuyen directamente a su regulación hídrica. Además, proveen refugio y alimento a diversos organismos como insectos, aves y mamíferos. Asimismo, las orquídeas son importantes comercialmente como plantas ornamentales, medicinales, como flor de corte para exportación y para extracción de esencias como la vainilla. Es por ello que al momento de propagarlas y distribuirlas se hace necesario tenerlas plenamente identificadas para conservar adecuadamente las características de los germoplasmas. Debido a que se ha demostrado que las características fenotípicas son insuficientes para la identificación de estas plantas, se desarrolló este estudio con el objeto de evaluar el uso de marcadores moleculares de cloroplasto (MAT-K, YCF-1 y TRNL-TRNF) y nuclear (ITS) para la identificación de diferentes géneros de orquídeas, en estado de plántula. En esta investigación se estandarizaron protocolos de PCR para los marcadores moleculares presentados, con el fin de desarrollar técnicas replicables de identificación molecular de orquídeas. Se realizó la identificación a nivel de género de los germoplasmas analizados utilizando el marcador molecular TRNL- TRNF. De esta manera se genera conocimiento de base científica y tecnológica que ayude al aprovechamiento sostenible y responsable de orquídeas a nivel nacional.

Palabras clave

Plantas ornamentales, Caracterización molecular, Cattleya, Cloroplasto

Citación