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16S rRNA phylogeny outperforms similarity thresholds for species identification and reveals genus-dependent underestimation of Lactobacillales diversity

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dc.contributor.advisorYepes Medina, Verónica
dc.contributor.advisorVillegas Escobar, Valeska
dc.contributor.advisorDíaz Nieto, Juan Fernando
dc.contributor.authorRojas Villegas, Alejandra
dc.contributor.sponsorNovonesis y Universidad EAFIT
dc.coverage.spatialMedellín de: Lat: 06 15 00 N degrees minutes Lat: 6.2500 decimal degrees Long: 075 36 00 W degrees minutes Long: -75.6000 decimal degrees
dc.creator.emailarojasv2@eafit.edu.co
dc.date.accessioned2026-08-03T20:06:23Z
dc.date.available2026-08-03T20:06:23Z
dc.date.issued2026-05-14
dc.description.degreelevelTrabajospa
dc.description.degreenameBiólogo(a)spa
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameinstname:Universidad EAFIT
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional Universidad EAFIT
dc.identifier.repourlrepourl:https://repository.eafit.edu.co
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10784/38237
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad EAFITspa
dc.publisher.departmentÁrea Sistemas Naturales y Sostenibilidadspa
dc.publisher.facultyEscuela de Ciencias Aplicadas e Ingenieríaspa
dc.publisher.placeMedellín
dc.publisher.programBiologíaspa
dc.rightsTodos los derechos reservadosspa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_16ec
dc.rights.localAcceso restringido
dc.subjectARNr 16S
dc.subjectLactobacillales
dc.subjectReconstrucción filogenética
dc.subjectIdentificación de especies
dc.subject.keywordOxford Nanopore Technologies
dc.subject.keywordPhylogenetic reconstruction
dc.subject.keywordSpecies identification
dc.subject.lembBACTERIAS -IDENTIFICACIÓN
dc.subject.lembFILOGENIA (BOTÁNICA)
dc.subject.lembBIOLOGÍA - INVESTIGACIONES
dc.subject.lembMICROBIOLOGÍA - INVESTIGACIONES
dc.title16S rRNA phylogeny outperforms similarity thresholds for species identification and reveals genus-dependent underestimation of Lactobacillales diversity
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.coarversionhttp://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
dc.type.localTrabajo de gradospa
dc.type.redcolhttp://purl.org/redcol/resource_type/TP
dc.type.spaOtro
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/acceptedVersion
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