Elaboración de un catálogo de bacterias cultivables como línea base de aislamientos con potencial hidrocarbonoclasta, de dos zonas con alta influencia petrolífera en Colombia

Resumen

From suspensions of environmental substrates (water, soil and sediment) from two zones with high oil influence in the country (Magdalena and Casanare) were isolated through conventional cultivation, 200 strains that formed the baseline of a catalog of bacterial biological interpretation. In this study, emphasis was placed on the cultivation process, isolation and integral identification (morphological, biochemical and genetic) of the isolates, with a view to understanding the repertoire and its functional dynamics. Molecular identification is based on genomic analysis from DNA sequencing and direct amplification of the 16s gene rRNA from bacterial biomass. Additionally, through the use of a minimal medium of salts supplemented with hydrocarbons at 1% v/v as the only carbon source, 27 were identified strains with hydrocarbonoclastic potential. The strains identified as tolerant to crude and bacterial consortia inoculated from soil samples directly, were tested of biodegradation, evaluating the percentage transformation of total hydrocarbons of oil (HTP) in 30 days of incubation. The biodegradation rates of HTP were determined under gas chromatography analysis coupled to a flame ionization detector (GCFID) and were related to the growth kinetics (CFU/mL) of the isolates through of the incubation time (30 days). Under observation time and post-identification molecular biodegradation of the isolates members of genera such as: Bacillus, Pseudomonas, Enterobacter and Burkholderia-Caballeronia-Paraburkholderia, in a range between 53.66 and 82% and in one of the consortiums 91.28%. The strains evaluated demonstrated an important enzymatic potential to degrade hydrocarbons and provide the opportunity to continue with the study of the bioremediation potential in areas affected by hydrocarbon contamination.

Descripción

Desde suspensiones de sustratos ambientales (agua, suelo y sedimento) de dos zonas con alta influencia petrolífera del país ( Magdalena y Casanare) se aislaron a través de medios convencionales de cultivo, 200 cepas que conformaron la línea base de un catalogo de interpretación biológica bacteriana. En este estudio se hizo énfasis en el proceso de cultivo, aislamiento e identificación integral ( morfológica, bioquímica y genética) de los aislamientos, con miras a la comprensión del repertorio y su dinámica funcional. La identificación molecular se basó en análisis genómicos a partir de la secuenciación de ADN y amplificación directa del gen 16s rARN desde biomasa bacteriana. Adicionalmente, a través del uso de un medio mínimo de sales suplementado con hidrocarburos al 1% v/v como única fuente de carbono, se identificaron 27 cepas con potencial hidrocarbonoclasta. Las cepas identificadas como tolerantes al crudo y consorcios bacterianos inoculados de muestras de suelo directamente, se sometieron a pruebas de biodegradación, evaluando la transformación porcentual de hidrocarburos totales de petróleo (HTP) en 30 d as de i incubación. Las tasas de biodegradación de HTP, se determinaron bajo un análisis de cromatografía de gases acoplado a un detector de ionización de llama (GCFID) y se relacionaron con la cinética de crecimiento (UFC/mL) de los aislamientos a través del tiempo de incubación(30 días). Bajo el tiempo de observación y posterior a la identificación molecular se evidenció l a biodegradación de l os aislamientos miembros de géneros como: Bacillus, Pseudomona, Enterobacter y Burkholderia-Caballeronia-Paraburkholderia, en un rango entre el 53.66 y 82 % y en uno de l os consorcios del 91.28 %. Las cepas evaluadas demostraron un importante potencial enzimático para degradar hidrocarburos y brindan l a oportunidad de continuar con el estudio del potencial de biorremediación en áreas afectadas por contaminación de hidrocarburos.

Palabras clave

Hidrocarbonoclastas, Biodegradación crudo, Catálogo bacteriano

Citación