Coalescent-delimitation framework and ecogeographic patterns disentangle the species boundaries within the Neotropical mouse-opossums subgenus Marmosops

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dc.contributor.advisorDíaz Nieto, Juan Fernandospa
dc.contributor.authorCarillo Restrepo, Jhan Carlos
dc.coverage.spatialMedellín de: Lat: 06 15 00 N degrees minutes Lat: 6.2500 decimal degrees Long: 075 36 00 W degrees minutes Long: -75.6000 decimal degreeseng
dc.creator.degreeMagíster en Biocienciasspa
dc.creator.emailjcarril4@eafit.edu.cospa
dc.date.accessioned2023-10-10T00:32:19Z
dc.date.available2023-10-10T00:32:19Z
dc.date.issued2022
dc.descriptionEl Neotrópico abarca una amplia gama de biomas y tipos de hábitat que lo ubican como una de las regiones más importantes de la Tierra, para comprender la prevalencia de la diversidad críptica y desconocida. Sin embargo, se ha demostrado que esta región es una de las menos representadas en cantidad de datos genéticos en el árbol de la vida. Por lo tanto, avanzar en revisiones genéticas intra e interespecíficas en esta región representa una prioridad científica importante para reducir nuestro desconocimiento sobre la biodiversidad desconocida del planeta. Los marsupiales americanos del subgénero Marmosops se distribuyen en una amplia variedad de hábitats neotropicales, por lo que es un grupo atractivo para realizar estudios sobre los procesos de diversificación neotropicales, pero dicha investigación se ve obstaculizada por el hecho de que aún no comprendemos completamente los límites de especies de algunos grupos dentro del subgénero. En este documento, evaluamos la independencia evolutiva de 13 haplogrupos de ADNmt morfológicamente crípticos dentro de Marmosops, los cuales fueron identificados por nuestros análisis previos de delimitación de especies mediante un solo locus. Para este propósito, analizamos un conjunto de datos de múltiples locus (12 loci nucleares no ligados y un locus de mtDNA) bajo un marco Bayesiano Coalescente de Múltiples Especies. Se implemento el programa BPP, combinado con un criterio heurístico (gdi) que incorpora el proceso continuo de especiación en los análisis de delimitación de especies, para comprender mejor los límites genéticos dentro de este clado de zarigüeyas neotropicales. Nuestros análisis de BPP recuperaron cada uno de los 13 haplogrupos como linajes evolutivos independientes. Sin embargo, la delimitación heurística (gdi) mostró que los linajes probados se encuentran en todo el espectro continuo de especiación, y que solo siete linajes reconocidos por BPP corresponden a especies "verdaderas". Tres de estos siete linajes se reconocen actualmente como especies válidas, lo que demuestra la eficacia de nuestro estudio; mientras que la información de patrones ecogeográficos reveló que los cuatro linajes restantes tienen información prometedora para ser reconocidos como posibles nuevas especies para la ciencia.spa
dc.description.abstractThe Neotropics encompasses a wide range of biomes and habitat types that place it as one of the most important Earth's regions for understanding the prevalence of cryptic and unknown diversity. However, it has been shown that this region is one of the least represented in genetic data in the tree of life. Therefore, advancing intra and interspecific genetic revisions in this region represents a major scientific priority to reduce our ignorance of the planet's biodiversity. American marsupials of Marmosops subgenus are distributed in a wide variety of Neotropical habitats, so it is an attractive group to undertake studies on Neotropical diversification processes, but such research is hindered by the fact that we do not yet fully understand the species limits of some groups within the subgenus. Herein, we evaluate the evolutionary independence of 13 morphologically-cryptic mtDNA haplogroups within Marmosops that were identified by our previous single-locus species delimitation analyses. For this purpose, we analyzed a multi-locus dataset (12 unlinked nuclear loci and one mtDNA locus) in a Bayesian Multi-Species Coalescent framework implemented in BPP, combined with heuristic criterion (gdi) that incorporated the speciation-continuum process into species delimitation analyses, to further understand the genetic boundaries within this Neotropical mouse opossum’s clade. Our BPP analyses recovered each of the 13 haplogroups as independent evolutionary lineages. However, heuristic gdi showed that the tested lineages are across the entire spectrum of the speciation continuum, and that only seven lineages recognized by BPP correspond to “true” species. Three of these seven lineages are currently recognized as valid species, demonstrating the effectiveness of our study; while ecogeographic patterns information revealed that the remaining four lineages have promising information to be recognized as possible new species for science.spa
dc.identifier.ddc599.2 C317
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10784/33041
dc.language.isospaspa
dc.publisherUniversidad EAFITspa
dc.publisher.departmentEscuela de Ciencias Aplicadas e Ingeniería. Departamento de Ciencias Biológicasspa
dc.publisher.placeMedellínspa
dc.publisher.programMaestría en Biocienciasspa
dc.rightsTodos los derechos reservadosspa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/closedAccessspa
dc.rights.localAcceso cerradospa
dc.subjectModelo coalescente multiespeciespa
dc.subjectDelimitación heurísticaspa
dc.subjectGDIspa
dc.subject.keywordCoalescent (MSC)spa
dc.subject.keywordHeuristic delimitationspa
dc.subject.keywordDidelphidaespa
dc.subject.keywordMarmosopsspa
dc.subject.lembMAMÍFEROSspa
dc.subject.lembECOSISTEMAS TERRESTRESspa
dc.subject.lembREGIONES BIOGEOGRÁFICASspa
dc.subject.lembMARSUPIALESspa
dc.titleCoalescent-delimitation framework and ecogeographic patterns disentangle the species boundaries within the Neotropical mouse-opossums subgenus Marmosopsspa
dc.typemasterThesiseng
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesiseng
dc.type.localTesis de Maestríaspa
dc.type.spaArtículospa

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